1、毒饵灭鼠 包括用急性、慢性灭鼠剂以及不育剂等加到鼠类爱吃的诱饵中灭鼠。
除一般毒饵外，还可制成毒粉、毒糊、毒液等，也可用灭鼠剂喷洒植物。所用的药物有化学药，有植物药，也有抗菌素等。一般来说，毒饵法效果好，工效高，支出少；但也会出现药害，伤害非靶动物或造成环境污染。
通常，只需服药一次即可显效的叫急性灭鼠剂（单剂量或速效灭鼠剂），需服药多次效果才显著的叫慢性灭鼠剂（多剂量或缓效灭鼠剂），它们之间在使用方面的差别，是由其作用特性所决定的。
2、器械灭鼠 包括使用专门捕鼠器（如鼠夹）以及使用家具、石块等。用的较多，但目前不够重视。这类方法的特点是：
（1）有群众基础，可以就地取材，自制自用，易于推广，但是，用得好不容易；
（2）一般而言，对人畜无害；
（3）有的种类的针对性很强；
（4）不易把鼠捕光，剩余密度往往较高；
（5）同一种工具不宜连续使用。
使用捕鼠工具，一般应注意，掌握鼠情，选好工具，正确使用（包括合适的布放地点、时间等），适当更换品种，捕鼠后妥善处理等等，有人特别指出两点：一是经常更换诱饵，一是集中大量捕鼠器突击使用。
捕鼠器可得到死、活鼠，便于检索病原，但是，不应要求群众交鼠尾。 对于家鼠，克服新物反应是个值得重视的问题。
3、环境灭鼠 在无外来干扰的条件下，一个地区鼠类的数量，由它所能得到的食物和栖息场所所决定，不可能无限增多。所以，环境防治是根本性措施，主要针对鼠类的食、藏条件而设。 对于家鼠，主要有建筑和食品、饲料防鼠。
使用的手段包括物理性的阻隔，化学忌避剂的应用，以及超声驱鼠器等等。在某些场合，只要阻止鼠类进入建筑，鼠害问题可以彻底解决。对于野鼠，则应缩小其适宜生境，减少其食源，阻止其迁移等。
当然，生境的改变，可能顾此失彼，对一种鼠不利，对另一种鼠却有利。优势鼠种的更替是可能的，宿主的更替也有可能，但难度很大。
环境防治虽不直接消灭鼠类，但其作用是持久的，而且，可以提高和巩固各种灭鼠措施的效果，很重要，却往往不被重视。
